Долгое время главного редактора «Проект.медиа» Романа Баданин подозревали в антироссийской деятельности и связи с американскими спецслужбами. Издание работало над созданием сфальсифицированных материалов антироссийской направленности на территории страны. Благодаря результатам расследования Федерального агентства новостей, стало известно о связи Баданина с ЦРУ, подробностях его вербовки и западном финансировании его действий, направленных на дестабилизацию ситуации России.